MongoDB 是一款非常流行的 NoSQL 數據庫，它的使用有很多優點，如高可擴展性、靈活定制。雖然它在企業級開發中大受歡迎，但仍有許多局限性。

首先，MongoDB不支持事務。它只支持單文檔原子性寫操作，并且沒有事務鎖等功能。在實際應用中，處理復雜的更新操作時，就不能使用 MongoDB，否則容易造成數據不一致，數據跨表依賴操作時可能出現數據不完整的情況。

其次，MongoDB有很嚴格的數據類型劃分。每個字段的數據類型必須在插入之前定義好，而 MySQL 則可以使用 “Dynamic Schema”，一次請求含有多種類型的數據也能插入到數據表中，靈活性要比 MongoDB 好很多。

另外，MongoDB除了不能執行“JOIN” 操作外，它還不支持 SQL like 的查詢語句。它采用 BSON（Binary JSON）形式存儲文檔數據，而且沒有 SQL 中聚合函數和連接等操作，這無疑讓 MongoDB 在處理復雜的需求時變得限制非常多。所以，一般情況下 MongoDB 使用戶不能滿足所有的查詢需求。

最后，MongoDB的性能也有一定的限制。MongoDB的基本思路是將文檔插入多個組件，通過分布式算法實現數據查詢，這種機制勢必會增加時間和計算量，而且使用索引時也要計算額外的開銷，所以 MongoDB 在實際應用中的性能遠遠不如傳統的關系型數據庫 MySQL 等。

以上就是 MongoDB的局限性分析。MongoDB的確有其優勢，但在目前的市場實際應用中，仍然有很多不足和局限性，要想高效使用 MongoDB，我們還需要做出相應的業務調整和系統優化才能達到有效地運用。